薬剤師2年目の年収・昇給額｜経験1〜4年の統計と僕の実額395万

新卒から途切れず働いた薬剤師2年目は、経験1〜4年の統計による年収換算約478万円が参考になります。2年目だけを集計した平均ではなく、所定内給与額×12＋年間賞与で算出した、残業代を含まない額です。

一方で、基本給の昇給は小さい職場が多く、6月からは住民税の天引きも始まります。「年収は上がったのに、毎月の手取りは減った」と感じやすいのが2年目です。

地方の内科門前の調剤薬局にいた僕の2年目は、約395万円でした。昇給は1回あたり月5千〜1万円ほどです。この記事では、統計の平均と僕の実額を分けて並べ、昇給額の相場と手取りが減る仕組みを数字で整理します。

薬剤師2年目の年収の参考値｜経験1〜4年の統計で約478万円

数字の出どころは、厚生労働省の令和7年賃金構造基本統計調査（職種・年齢階級・経験年数階級別）です。薬剤師の欄を経験年数ごとに見ると、次のようになります。

経験年数	月の給与 年間賞与	年収の目安
0年	月33.6万 賞与8.3万	約411万
1〜4年	月33.4万 賞与77.3万	約478万
5〜9年	月35.3万 賞与93.1万	約516万

新卒から継続勤務した2年目は通常、経験1年台なので「経験1〜4年」を参考にします。統計の経験年数は、免許取得後にその職種に実際に従事した期間を通算し、休職期間を除いたものです（厚生労働省「用語の解説」）。資格取得からの年数や今の会社での勤続年数と、常に同じになるわけではありません。

1年目の夏の賞与は、在籍期間が短く少額になりやすいものです。2年目は賞与の算定期間がそろうので、年収の伸びの多くは基本給ではなく賞与から来ます。

読むときの注意が2つあります。

• 残業代は含まれていない
• 2年目〜5年目がまとめて入る

所定内給与は、毎月決まって出る給与から残業代などを引いた額です。区分には5年目まで入るので、2年目だけで見ればこれより少し低めに出ると考えてください。

勤め先の規模で変わる年収

同じ調査は企業の規模別にも集計しています。薬剤師・経験1〜4年を規模で分けると、こうなります。

企業規模	年収の目安
10〜99人	約543万
100〜999人	約463万
1,000人以上	約475万

令和7年の調査では、10〜99人の区分がいちばん高く、ほかの2つより70〜80万円ほど高く出ています。前年の調査では逆に、この区分がいちばん低く出ていました。人数の少ない区分は年によって数字が大きく動くので、会社の大きさだけで高い・低いを決めつけずに見てください。

この調査には「調剤薬局」「ドラッグストア」「病院」といった業態の区分がありません。ドラッグストア併設の職場は提示額が高めになりやすいですが、僕が28歳で移ったDS併設の調剤Bは、年収550万円の代わりに月の残業が45時間ありました。額面だけで比べないほうがいいと思います。

額面から手取りがいくらになるかは、薬剤師の手取り早見表で年収ごとに出しています。

僕の薬剤師2年目は年収約395万円だった（調剤薬局Aの実額）

ここからは統計ではなく、僕個人の実額です。24歳で新卒入社したのは、地方にある内科クリニックの門前の調剤薬局Aでした。

年次	僕の年収	前年から
1年目	約380万	－
2年目	約395万	＋15万
3年目	約405万	＋10万
4年目	420万	＋15万

基本給の昇給は、1回あたり月5千〜1万円ほどでした。年に直すと6〜12万円です。1年目から2年目で年収が15万円増えていても、毎月の給与明細で見える変化はこの程度でした。

統計の約478万円と比べると、80万円ほど低い位置です。地方の門前薬局で、もともとの給与水準が高くなかったのが大きいと思います。

2年目になると、調剤も監査も投薬も一通り回せるようになります。仕事に慣れて任される量は増えたのに、給料はほぼ横ばい。「できることは増えたのに、給料は置いていかれる」感覚が、この頃から続いていました。

給料が横ばいだった2年目に何を意識していたかは、薬剤師2年目の目標に書きました。3年目・4年目の実額は、それぞれ別の記事にまとめています。

• 薬剤師3年目の給料・年収
• 薬剤師4年目の給料・年収

薬剤師の昇給額はいくらが普通か

「月5千円の昇給は少なすぎるのか」を、公的な数字で確かめます。薬剤師だけの昇給額を出している統計はないので、2つの資料から見ていきます。

業種別の賃上げ額

厚生労働省の令和7年賃金引上げ等の実態に関する調査では、1人平均の賃金の改定額（月額）がこう出ています。

• 全体：13,601円
• 卸売業，小売業：12,183円
• 医療，福祉：5,589円

対象は常用労働者100人以上の民間企業で、定期昇給とベースアップの両方を含みます。薬剤師以外の職種も入った数字なので、目安として見てください。病院は「医療，福祉」に入り、この業種の改定額は全体の半分以下です。

経験年数ごとの給与の差

もう一つは、さきほどの賃金構造基本統計調査の表です。薬剤師の月の給与は、経験0年33.6万円、1〜4年33.4万円、5〜9年35.3万円でした。

令和7年の調査では、0年と1〜4年がほぼ同じで、1〜4年と5〜9年の差も月2万円ほどです。経験の区分が上がっても、月の給与の差は大きくありません。同じ人を追いかけた数字ではなく、年によっても動くので、あくまでざっくりした比較です。

2つを合わせると、1回あたり月5千〜1万円の昇給は、珍しく低い額ではないと言えそうです。月5千円だと低めの側ではあります。

自分の職場で今後どこまで上がるかは、次の3つで見当がつきます。

1. 給与規程の昇給幅
2. 賞与が何か月分か
3. 役職手当の有無と額

3つは、見る順番があります。先に昇給幅を見て、次に賞与、最後に役職です。

昇給幅は、給与規程に賃金表があればそこで分かります。表が無い職場なら、去年と今年の4月の明細で基本給を並べてください。手当だけが増えて基本給が動いていない場合、賞与には反映されにくいです。

賞与は「何か月分」の元になる金額を確かめます。基本給だけに掛けるのか、手当も含めるのかで、同じ月数でも額が変わります。

役職は、額よりも席が空くかどうかです。管理薬剤師の席は店ごとに限られるので、店舗が増えていない会社では順番待ちになります。シフトを組む側から見ても、上が動かない店では手当の付く役割がなかなか回ってきません。

僕の今の職場では、管理薬剤師手当が月3〜5万円つきます。昇給の数年分が一度に乗る額なので、役職の枠があるかどうかは大きいです。昇給が止まったときの考え方は、薬剤師が昇給しないのは普通かで詳しく書いています。

薬剤師2年目の手取りが6月から減る理由は住民税

2年目の6月の明細で「昇給したのに手取りが減った」と気づく人は多いと思います。原因はほぼ住民税です。薬局がケチなわけでも、評価が下がったわけでもありません。

住民税は前年の所得にかかる

住民税の所得割は、前年1月〜12月の所得をもとに計算されます。会社員は、その税額を6月から翌年5月までの12回に分けて給与から天引きされます（東京都主税局「個人住民税」）。

学生だった前年は、給与所得がほとんどありません。だから1年目は、住民税がほぼ引かれないまま1年が過ぎます。

2年目の税額は9か月分

2年目の6月から引かれるのは、1年目の暦年、つまり4月〜12月の9か月分の給与にかかる住民税です。

1年目の1〜3月はまだ学生なので、この年の所得は1年分より少なくなります。そのぶん、2年目に引かれる住民税はまだ小さめです。

手取りは月いくら減る？

住民税の所得割は税率10％、均等割は年4,000円、2024年度からは森林環境税1,000円が一緒に課税されます（総務省「個人住民税」）。これをもとに、ざっくり試算します。

前提は、1年目の4〜12月の給与と賞与の合計が300万円、扶養なし、社会保険料を収入の約15％とした場合です。

1. 給与所得：約202万円
2. 控除後の所得：約114万円
3. 住民税：年約11.7万円
4. 月あたり：約1万円

給与所得は、収入から給与所得控除（300万円なら98万円）を引いた額です。そこから社会保険料45万円と住民税の基礎控除43万円を引き、10％を掛けて調整控除と均等割を加減しています。

昇給が月5千〜1万円なら、住民税の約1万円でほぼ相殺されます。昇給したのに手取りが同じか少し減るのは、この組み合わせのせいです。

そうなんです。金額は住んでいる自治体や控除で前後するので、正確な額は5〜6月ごろに会社経由で届く「特別徴収税額の決定通知書」で確かめてください。

3年目の6月にもう一度増える

見落としやすいのがここです。3年目の6月からは、2年目の1月〜12月、つまり丸1年分の所得に住民税がかかります。

同じ前提で年収400万円として試算すると、住民税は年約17.6万円、月約1.5万円です。2年目より月5千円ほど天引きが増える計算になります。

2年目と3年目の6月は、昇給分が住民税の増加で消えやすい時期です。家計を組むときは、この2回の増加を見込んでおくと慌てずに済みます。

薬剤師2年目で転職を考えたときの見極め方

給料が上がらないと、転職が頭をよぎる時期だと思います。先に僕の考えを書くと、給料だけが理由なら、2年目で急いで動かなくていいです。

理由は2つあります。2年目の手取り減は住民税の仕組みによるもので、職場を変えても同じように引かれます。もう一つは、在籍が短いと面接で確かめられることが増える点です。

僕は今、管理薬剤師として採用の一次面接もしています。面接する側からすると、在籍が2年に満たない人には、辞める理由と次は続けられるかをどうしても聞きたくなります。

僕自身、焦って決めた転職で失敗しています。30歳のとき、DSを早く抜けたい一心で移った調剤薬局Cを2ヶ月で辞めました。職場見学を自分から断っていたのが原因です。2回の失敗の経緯は自己紹介の記事に書いています。

ただし、給料以外で次のような状態なら、情報集めだけは早めに始めて損はないと思います。

• 人間関係で心身がしんどい
• 残業が多くて体を壊しそう
• 統計より大幅に低い
• 数年いても上がる見込みがない

上の2つは体と気持ちの話なので、数字を待たずに動いていい理由です。下の2つは、数字で確かめてから決められます。

条件	確かめ方	分かれ目
統計より 低い	残業代を除いた 年収で比べる	条件をそろえても 差が大きいか
上がる 見込み	昇給幅と 役職の席を見る	3年後の額が 今とほぼ同じか

統計と比べるときは、条件をそろえるのが先です。約478万円は残業代を含まず、2〜5年目がまとめて入った数字でした。自分の年収から残業代を引いた額で並べてください。

動くと決めたなら、面接で聞かれることを先に用意しておくと楽です。在籍が短い人に面接する側が確かめたいのは、次の2つです。

• なぜ今の職場を離れるのか
• 次は何を確かめて選んだか

「給料が低いから」だけだと、面接する側は「うちでも同じ理由で辞めるのでは」と考えます。昇給幅や賞与を確かめたうえで判断した、と順を追って話せる人は、在籍が短くても印象が変わります。

動くと決めた場合も、賞与の在籍条件は先に確かめてください。支給日に在籍していることを条件にしている会社があります。退職日を決める前に、就業規則や給与規程で支給日と条件を見ておくと損をしにくいです。

今の職場が地方の中小薬局で、統計より大きく低いと感じているなら、まず相場を知るところからで十分です。たとえばファゲット薬剤師は、公式サイトで「中小調剤薬局の求人・病院薬剤師の求人に強く」と案内している転職サービスです。僕自身は使っていませんが、相談は無料と書かれています。

ほかのサービスとの違いは、薬剤師転職エージェントのおすすめ比較で並べています。

薬剤師2年目の年収・給料でよくある質問

薬剤師2年目の年収は平均でいくらですか？

2年目だけの平均はこの表では分かりません。新卒から継続勤務した2年目の参考として、経験1〜4年の統計を使います。厚生労働省の令和7年賃金構造基本統計調査で、薬剤師・経験1〜4年は月の所定内給与33.4万円、賞与77.3万円です。年収換算で約478万円で、残業代は含みません。

1年目より年収が上がるのはなぜですか？

主に賞与です。1年目は在籍期間が短く賞与が少なめですが、2年目は算定期間がそろいます。統計でも賞与は経験0年の8.3万円から、1〜4年で77.3万円に増えています。

2年目の昇給が月5千円なのは普通ですか？

低めの側ですが、珍しい額ではないと思います。令和7年の厚労省調査で、医療，福祉の1人平均の賃金改定額は月5,589円でした。僕の調剤薬局Aでも、1回あたり月5千〜1万円でした。

昇給したのに手取りが減ったのはなぜですか？

2年目の6月から住民税の天引きが始まるからです。住民税は前年の所得にかかるので、1年目はほぼ引かれていません。昇給額より住民税が大きいと、手取りが減ります。

住民税で手取りは月いくらくらい減りますか？

1年目の4〜12月の収入が300万円なら、試算で月1万円前後です。自治体や控除で前後するので、会社経由で届く特別徴収税額の決定通知書で確かめてください。

3年目になると手取りは戻りますか？

3年目の6月からは、2年目の丸1年分の所得に住民税がかかります。年収400万円の試算で月1.5万円ほどになり、2年目より月5千円ほど天引きが増えます。

自分の年収が平均より低いのですが大丈夫ですか？

統計の約478万円は2〜5年目をまとめた数字で、企業規模の区分によっても約463万〜543万円と幅があります。僕の2年目は約395万円でした。額そのものより、今の職場でこの先どこまで上がるかを見てください。

2年目で転職するのはアリですか？

給料だけが理由なら、急がなくていいと思います。手取りの減少は住民税の仕組みで、職場を変えても同じです。心身がつらい、統計より大幅に低いといった事情があるなら、情報集めは早めに始めて損はありません。

今の職場で年収を上げる方法はありますか？

給与規程の昇給幅、賞与の月数、役職手当の3つを確かめると見通しが立ちます。僕の今の職場では、管理薬剤師手当が月3〜5万円つきます。

薬剤師2年目の年収についてのまとめ

新卒から継続勤務した薬剤師2年目の参考となる経験1〜4年の統計は、残業代を含まない年収換算で約478万円です。2年目だけの平均ではありません。僕の実額は統計と分け、残業や賞与、役職などの条件を確かめて比べてください。

手取りが減ったのは、評価のせいではなく住民税の仕組みです。見るべきなのは今の額より、給与規程や役職手当から分かる「この先どこまで上がるか」です。

僕はAで4年働いて420万円になり、28歳で職場を変えました。そこから2回失敗して、30歳の3回目の転職で今の610万円になっています。年次ごとの年収は薬剤師10年目の給料・年収まで続けて書いているので、先の見通しを立てる材料にしてください。

転職で年収を上げるときにどのサービスを選ぶかは、薬剤師転職エージェントのおすすめ比較にまとめています。